Lancement de CIbig

  • Pertinence de la crΓ©ation du CIBiG
Les avancΓ©es scientifiques et technologiques offrent la possibilitΓ© d’adresser de nouvelles problΓ©matiques en biologie avec des applications dans diffΓ©rents domaines. Parmi ces avancΓ©es majeures, le dΓ©veloppement rapide des technologies de sΓ©quenΓ§age a permis une vΓ©ritable rΓ©volution pour les recherches en sciences de la vie et de la santΓ©. Les nouvelles gΓ©nΓ©rations de sΓ©quenceurs (NGS) en particulier permettent le sΓ©quenΓ§age en quelques jours de gΓ©nomes entiers d’organismes complexes, gΓ©nΓ©rant une importante masse d’informations gΓ©nomiques. La qualitΓ© des donnΓ©es gΓ©nomiques produites et leur interprΓ©tation adΓ©quate sont des facteurs critiques devant permettre d’adresser la complexitΓ© des questions scientifiques de la vie et de la santΓ©. L’appropriation par les biologistes des techniques de production de donnΓ©es gΓ©nomiques et des mΓ©thodes et outils de biostatistique et bioinformatique intΓ©grative est un enjeu majeur pour la montΓ©e en compΓ©tence des Γ©quipes de recherche et des plateformes scientifiques. C’est dans le but de contribuer au renforcement de capacitΓ©s des Γ©quipes de recherche que le Centre RΓ©gional d’Excellence WAVE pour les phytopathogΓ¨nes transfrontaliers, a mis en place en partenariat avec l’IRD et l’UJKZ, le CIBiG qui plus qu’une formation, incarne l’engagement envers l’excellence, l’innovation et le dΓ©veloppement continu.
  • Objectifs du Certificat
Le CIBiG est pluridisciplinaire et vise Γ  permettre aux participants d’acquΓ©rir des compΓ©tences techniques et scientifiques telles que le sΓ©quenΓ§age de gΓ©nomes, l’utilisation avancΓ©e de cluster de calcul (linux, slurm), la programmation en python, la reproductibilitΓ© des donnΓ©es/science ouverte (git, singularity) et la spΓ©cialisation dans des domaines spΓ©cifiques de la bioinformatique (ex : Analyses mΓ©tagΓ©nomique, SNPs). Les compΓ©tences acquises permettront aux participants de gΓ©rer l’ensemble du processus d’une analyse bioinformatique, de sa conception Γ  l’analyse des donnΓ©es.
  • Le CIBiG en bref

Le CIBiG se dΓ©roule en trois grandes phases :

  • Phase 1 : des cours en ligne sur les bases de la biologie gΓ©nΓ©rale, la biodiversitΓ©, et la gΓ©nomique ;
  • Phase 2 : des cours thΓ©oriques et des travaux pratiques en sΓ©quenΓ§age (construction de banques, sΓ©quenΓ§age illumina et Nanopore), en informatique (linux, bash, slurm, python, R) et en bioinformatique (analyse de donnΓ©es de sΓ©quenΓ§age illumina et Nanopore, dΓ©tection de SNPs, mΓ©tagΓ©nomique) en prΓ©sentiel (153h) ;
  • Phase 3Β : un projet tutorΓ© d’un mois dans un laboratoire.

Le CIBiG est ouvert aux Γ©tudiants, biologistes, chercheurs, ingΓ©nieurs informaticiens exerΓ§ant en entreprise ou dans le public.

Niveau d’admission :

  • Au moins un Master ou Γ©quivalents en sciences biologiques, sciences de la santΓ© humaine et animale.
  • Bac+ 3 avec au moins 5 ans d’expΓ©rience pour les professionnels des organismes de recherche et des ministΓ¨res techniques.

Le nombre de places par session de formation est limitΓ© Γ  20 et la sΓ©lection se fait sur Γ©tude de dossier.

Pour plus d’informations, veuillez visiter le site : www.wave-center.org