Lancement de CIbig

  • Pertinence de la crรฉation du CIBiG
Les avancรฉes scientifiques et technologiques offrent la possibilitรฉ dโ€™adresser de nouvelles problรฉmatiques en biologie avec des applications dans diffรฉrents domaines. Parmi ces avancรฉes majeures, le dรฉveloppement rapide des technologies de sรฉquenรงage a permis une vรฉritable rรฉvolution pour les recherches en sciences de la vie et de la santรฉ. Les nouvelles gรฉnรฉrations de sรฉquenceurs (NGS) en particulier permettent le sรฉquenรงage en quelques jours de gรฉnomes entiers dโ€™organismes complexes, gรฉnรฉrant une importante masse dโ€™informations gรฉnomiques. La qualitรฉ des donnรฉes gรฉnomiques produites et leur interprรฉtation adรฉquate sont des facteurs critiques devant permettre dโ€™adresser la complexitรฉ des questions scientifiques de la vie et de la santรฉ. Lโ€™appropriation par les biologistes des techniques de production de donnรฉes gรฉnomiques et des mรฉthodes et outils de biostatistique et bioinformatique intรฉgrative est un enjeu majeur pour la montรฉe en compรฉtence des รฉquipes de recherche et des plateformes scientifiques. Cโ€™est dans le but de contribuer au renforcement de capacitรฉs des รฉquipes de recherche que le Centre Rรฉgional dโ€™Excellence WAVE pour les phytopathogรจnes transfrontaliers, a mis en place en partenariat avec lโ€™IRD et lโ€™UJKZ, le CIBiG qui plus quโ€™une formation, incarne lโ€™engagement envers lโ€™excellence, lโ€™innovation et le dรฉveloppement continu.
  • Objectifs du Certificat
Le CIBiG est pluridisciplinaire et vise ร  permettre aux participants dโ€™acquรฉrir des compรฉtences techniques et scientifiques telles que le sรฉquenรงage de gรฉnomes, lโ€™utilisation avancรฉe de cluster de calcul (linux, slurm), la programmation en python, la reproductibilitรฉ des donnรฉes/science ouverte (git, singularity) et la spรฉcialisation dans des domaines spรฉcifiques de la bioinformatique (ex : Analyses mรฉtagรฉnomique, SNPs). Les compรฉtences acquises permettront aux participants de gรฉrer lโ€™ensemble du processus dโ€™une analyse bioinformatique, de sa conception ร  lโ€™analyse des donnรฉes.
  • Le CIBiG en bref

Le CIBiG se dรฉroule en trois grandes phases :

  • Phase 1 : des cours en ligne sur les bases de la biologie gรฉnรฉrale, la biodiversitรฉ, et la gรฉnomique ;
  • Phase 2 : des cours thรฉoriques et des travaux pratiques en sรฉquenรงage (construction de banques, sรฉquenรงage illumina et Nanopore), en informatique (linux, bash, slurm, python, R) et en bioinformatique (analyse de donnรฉes de sรฉquenรงage illumina et Nanopore, dรฉtection de SNPs, mรฉtagรฉnomique) en prรฉsentiel (153h) ;
  • Phase 3 : un projet tutorรฉ dโ€™un mois dans un laboratoire.

Le CIBiG est ouvert aux รฉtudiants, biologistes, chercheurs, ingรฉnieurs informaticiens exerรงant en entreprise ou dans le public.

Niveau dโ€™admission :

  • Au moins un Master ou รฉquivalents en sciences biologiques, sciences de la santรฉ humaine et animale.
  • Bac+ 3 avec au moins 5 ans dโ€™expรฉrience pour les professionnels des organismes de recherche et des ministรจres techniques.

Le nombre de places par session de formation est limitรฉ ร  20 et la sรฉlection se fait sur รฉtude de dossier.

Pour plus dโ€™informations, veuillez visiter le site : www.wave-center.org